Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tfcp2Q9ERA0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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