Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms