Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hmgn3Q9DCB1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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