Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Med27Q9DB40 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Med27Q9DB40 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Med27Q9DB40 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Med27Q9DB40 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Med27Q9DB40 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Med27Q9DB40 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Med27Q9DB40 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Med27Q9DB40 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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