Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pdzd9Q9D9M4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pdzd9Q9D9M4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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