Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms