Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Srp19Q9D7A6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srp19Q9D7A6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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