Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt34Q9D646 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt34Q9D646 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms