Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gcc1Q9D4H2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gcc1Q9D4H2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms