Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hddc3Q9D114 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms