Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr3eQ9CZT4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms