Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Sgo1Q9CXH7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sgo1Q9CXH7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms