Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpainQ9CWY9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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