Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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