Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5aQ9CQD1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5aQ9CQD1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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