Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trappc5Q9CQA1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms