Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsnaxip1Q99P25 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms