Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln1Q99J21 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcoln1Q99J21 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms