Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atl3Q91YH5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atl3Q91YH5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms