Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pth2Q91W27 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pth2Q91W27 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms