Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Zkscan3Q91VW9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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