Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MyripQ8K3I4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MyripQ8K3I4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms