Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gpc3Q8CFZ4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gpc3Q8CFZ4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms