Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Ercc8Q8CFD5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ercc8Q8CFD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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