Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp5Q8BX09 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbbp5Q8BX09 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms