Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pggt1bQ8BUY9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pggt1bQ8BUY9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pggt1bQ8BUY9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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