Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms