Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp1Q8BJQ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp1Q8BJQ2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms