Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ubash3bQ8BGG7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ubash3bQ8BGG7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ubash3bQ8BGG7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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