Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htatsf1Q8BGC0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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