Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Smap2Q7TN29 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms