Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GypcQ78HU7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms