Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp34Q6ZQ93 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp34Q6ZQ93 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp34Q6ZQ93 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp34Q6ZQ93 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp34Q6ZQ93 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms