Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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