Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gja6Q6S5G4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gja6Q6S5G4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms