Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl2Q6PA06 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms