Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms