Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HelbQ6NVF4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms