Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc66Q6NS45 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc66Q6NS45 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms