Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fgd6Q69ZL1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms