Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tbr1Q64336 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tbr1Q64336 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms