Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Taf6Q62311 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Taf6Q62311 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms