Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sema5aQ62217 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms