Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sema3cQ62181 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms