Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lama3Q61789 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms