Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ifi47Q61635 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ifi47Q61635 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ifi47Q61635 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ifi47Q61635 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ifi47Q61635 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Ifi47Q61635 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ifi47Q61635 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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