Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PcolceQ61398 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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PcolceQ61398 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PcolceQ61398 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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PcolceQ61398 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PcolceQ61398 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms