Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tfap2bQ61313 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tfap2bQ61313 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms