Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ppp1r1bQ60829 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppp1r1bQ60829 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms