Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Stxbp3Q60770 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Stxbp3Q60770 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms